גופתו שליוסף חסין אלשקילי, נמצאה בשטח פתוח בפזורה הבדואית מסעודין אל עזאזמה, הממוקמת מזרחית לרמת חובב שבנגב. צוות מד"א שהגיע למקום מצא את הגבר, כשהוא מחוסר הכרה וקבע את מותו.
כוחות משטרה ממרחב נגב שהוזעקו למקום, פתחו בחקירה. ממנה עולה כי אלמונים קיססו בירי את רכבו של אלשקילי, , עד שאיבד שליטה והתנגש בעמוד. אז גם ביצעו ירי לעברו ראשו, וגרמו למותו. עם הגעת השוטרים, נמצא כי הרכב רוסס עם סימני קליעים באזור דלת הנהג. חלונות הרכב בצד הנהג רוססו גם כן, ונראה כי ניסו לגרום לחיסולו.
לאחר הערכת מצב שנערכה בידי מפקד מרחב נגב, תת ניצב נחשון נגלר, הוטלה החקירה בחשד לרצח על היחידה המרכזית (ימ"ר) נגב.